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Vincent Tardy

Chercheur en écologie microbienne

& créateur des services BioSEC

Bioinformatiques et Statistiques appliquées à l’Écologie des Communautés

BioSEC est un ensemble de services centré sur l'analyse de données issues des nouvelles technologies de séquençage dans le domaine de l'écologie. Ces services vont du conseil pour vos études, la réalisation de vos analyses bio-informatiques et statistiques jusqu’à l'interprétation et la valorisation de vos résultats.

 

Pourquoi ces services ?

L'analyse des données écologiques et particulièrement celles issues des issues des nouvelles technologies de séquençage (metabarcoding) demande beaucoup de temps et peut s'avérer fastidieuse pour des non initiés. BioSEC est là pour vous aider à réaliser vos analyses selon vos besoins et interprèter vos résultats. BioSEC vous conseille également sur les approches analytiques que vous pouvez utiliser pour exploiter au mieux votre jeu de données et répondre à vos questions.

Quel type de donnée ?

BioSEC analyse tout type de données : séquences ADN, table d'abondance d'espèces, base  de données (biologique, physique, chimique), etc.

Pour qui ?

Pour toutes les personnes qui ont des données génomiques et écologiques à interpréter et valoriser ! Ces services sont destinés aux établissements publiques (instituts de recherche, collectivités), aux établissements privés et aux associations qui réalisent des études dans le domaine de l'écologie (inventaire de diversité, étude d'impact, etc.)

Les services BioSEC

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Conseils

Analyses

bio-informatiques

Analyses

statistiques

Valorisation

Formations

Enseignements

Quelques exemples d'analyses réalisées

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Besoin d'un service ?

En savoir plus sur moi

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C'est dès mon plus jeune âge que je m’intéresse aux questions liées à la protection de l'environnement et à l'écologie. Cette curiosité m'a amené, dès le lycée, à suivre une formation technique dans les sciences agricoles et de l'environnement et de poursuivre ma formation jusqu’à l'obtention d'un doctorat  en écologie microbienne de sol.

Après ma thèse obtenue en 2014 au sein de l'UMR Agroécologie de Dijon, j'ai participé à plusieurs projets de recherche autour de l'écologie et de l'écotoxicologie microbienne au sein de différents instituts de recherche publiques (CNRS, INRAE, Université Savoie Mont Blanc). Mes activités de recherche visent principalement à (i) améliorer nos connaissances sur la diversité des communautés microbiennes indigènes et les filtres environnementaux régulant cette diversité et sa dynamique au sein de différents environnements et (ii) évaluer l’implication de la diversité microbienne dans le fonctionnement des écosystèmes.

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Ces dix années d'expériences dans la recherche m'ont permis d'acquérir de nombreuses compétences techniques et analytiques pour caractériser les communautés microbiennes dans différents environnements (sol, sédiment, biofilm et eau). Je maîtrise notamment les approches moléculaires de caractérisation de l’ADN environnemental ainsi que les outils bio-informatiques et statistiques adaptés à l’exploitation des données générées. Aujourd'hui, j'ai décidé de créer ma micro-entreprise et propose des services en analyses bio-informatiques et statistiques dédiés aux études et recherches dans le domaine des sciences environnementales et écologiques : les services BioSEC !

Si vous souhaitez en apprendre davantage sur mes formations, mon parcours professionnel, mes connaissances et compétences, consultez ma page CV ou téléchargez le ici !

Si vous voulez en savoir plus sur les recherches que j'ai réalisées en écologie microbienne, c'est ici !

Vous trouverez également toutes les publications scientifiques auxquelles j'ai participé, en libre accès ici !

Mes recherches

Diversité microbienne du sol, stabilité et cycle du carbone

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