Services BioSEC
Des services adaptés à chaque projet !
BioSEC est un ensemble de services centré sur l'analyse de données issues des nouvelles technologies de séquençage dans le domaine de l'écologie. Ces services vont du conseil pour vos études, la réalisation de vos analyses bio-informatiques et statistiques jusqu’à l'interprétation et la valorisation de vos résultats.
Services
Conseils
BioSEC apporte des conseils sur le design et la stratégie expérimentale de vos études en écologie, sur le choix de vos marqueurs ADN pour l'étude de différentes communautés (bactéries, champignons, invertébrés, poissons, etc.) et de communautés plus spécifiques. BioSEC développe également vos amorces pour l'étude de vos communautés.
Analyses bio-informatiques
BioSEC réalise l'analyse de vos données issues des technologies de séquençage nouvelles générations (Roche 454, illumina®, ion torrent) via différentes approches pour l'analyse de séquences : ASV (DADA2, Callahan et al., 2016) ou OTU (méthode de clustérisation SWARM, Mahé et al., 2014). BioSEC réalise aussi l'élaboration de vos bases de séquences de référence pour répondre à vos besoins analytiques.
Analyses statistiques
BioSEC réalise l'analyse de vos données par des méthodes statistiques pour répondre à vos besoins et questions. Quelques exemples d'approches statistiques utilisées en écologie : statistiques descriptives, analyses multivariées, partition de variance, géostatistique, réseaux de co-occurence, etc.
Valorisation
BioSEC réalise l'interprétation de vos résultats et leur valorisation sous forme de rapport, article scientifique, poster ou présentation.
Formation et enseignement
BioSEC réalise différentes formations sous l'environnement R: initiation à Rstudio, fonction de bases sous R, manipulation des données et formation sur certain package analytique (vegan, phyloseq, ade4, etc). BioSEC dispense également de cours (CM, TD et TP) en microbiologie, écologie, biologie moléculaire et statistiques pour des étudiants du niveau lycée jusqu'au Bac+5.
